Your comments

Исключите из бюджета счет "Кредит". Чтобы запланировать в бюджете перевод со счета "Наличные" на счет "Кредит", добавьте в бюджете расход "Перевод с бюджетных счетов".

Андрей Бондарь написал:
К сожалению, такой универсальный банкинг в масштабах интернет-проекта невозможен.
Нет ничего невозможного :) Очень сложен — это да. Это проект совершенно иного масштаба, в разы сложнее домашней бухгалтерии. В этом случае не интернет-банкинг будет интегрирован в домашнюю бухгалтерию, а в наоборот — учет финансов будет представлен как одна из возможностей интернет-банкинга.
По сути это как в PayPal интегрировать HomeMoney.

Ну это как Вам удобнее :)
У меня по-разному бывает — когда-то за два месяца планирую бюджет, а когда-то и дней за пять.

Зайдите в настройки Панели управления и поставьте галочку "учитывать в Балансе" напротив счета <НовыйСчет>

Это скорее идея, а не вопрос.

Почему бы этот вопросик не указать в примечании? Во вкладках Расходы/Доходы эти транзакции с вопросиками будут хорошо видны.

Чтобы увидеть график расходов по определенной категории, зайдите в "Анализ" и выберите ту категорию, по которой хотите увидеть динамику.

Эта идея обсуждается в этом вопросе.